Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Paf1Q8K2T8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Paf1Q8K2T8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Paf1Q8K2T8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Paf1Q8K2T8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Paf1Q8K2T8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Paf1Q8K2T8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Paf1Q8K2T8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Paf1Q8K2T8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms