Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf3Q8K268 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Abcf3Q8K268 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcf3Q8K268 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf3Q8K268 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf3Q8K268 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms