Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps53Q8CCB4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vps53Q8CCB4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps53Q8CCB4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps53Q8CCB4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps53Q8CCB4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps53Q8CCB4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps53Q8CCB4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps53Q8CCB4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps53Q8CCB4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps53Q8CCB4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps53Q8CCB4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps53Q8CCB4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms