Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tprg1Q8CB49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tprg1Q8CB49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tprg1Q8CB49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tprg1Q8CB49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tprg1Q8CB49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tprg1Q8CB49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tprg1Q8CB49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tprg1Q8CB49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tprg1Q8CB49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tprg1Q8CB49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tprg1Q8CB49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tprg1Q8CB49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms