Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp20Q8C6M1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp20Q8C6M1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp20Q8C6M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp20Q8C6M1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp20Q8C6M1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp20Q8C6M1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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