Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc169Q8BXX9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc169Q8BXX9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc169Q8BXX9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc169Q8BXX9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc169Q8BXX9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc169Q8BXX9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc169Q8BXX9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms