Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ssc5dQ8BV57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ssc5dQ8BV57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ssc5dQ8BV57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ssc5dQ8BV57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ssc5dQ8BV57 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ssc5dQ8BV57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ssc5dQ8BV57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ssc5dQ8BV57 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ssc5dQ8BV57 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ssc5dQ8BV57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ssc5dQ8BV57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ssc5dQ8BV57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms