Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup93Q8BJ71 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup93Q8BJ71 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup93Q8BJ71 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup93Q8BJ71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup93Q8BJ71 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup93Q8BJ71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup93Q8BJ71 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms