Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc40Q8BI79 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc40Q8BI79 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc40Q8BI79 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc40Q8BI79 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc40Q8BI79 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc40Q8BI79 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms