Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd2Q8BHD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcmtd2Q8BHD8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd2Q8BHD8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcmtd2Q8BHD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcmtd2Q8BHD8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms