Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc50Q810U5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc50Q810U5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc50Q810U5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms