Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfascQ810U3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NfascQ810U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfascQ810U3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NfascQ810U3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfascQ810U3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfascQ810U3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms