Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Liat1Q810M6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Liat1Q810M6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Liat1Q810M6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Liat1Q810M6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Liat1Q810M6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms