Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc1Q80VQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc1Q80VQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Lrrc1Q80VQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc1Q80VQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms