Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc29Q80VM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc29Q80VM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc29Q80VM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc29Q80VM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc29Q80VM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc29Q80VM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc29Q80VM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc29Q80VM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc29Q80VM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc29Q80VM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc29Q80VM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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