Protein–RNA interactions for Protein: Q80TY0

Fnbp1, Formin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnbp1Q80TY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fnbp1Q80TY0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fnbp1Q80TY0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fnbp1Q80TY0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fnbp1Q80TY0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fnbp1Q80TY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fnbp1Q80TY0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fnbp1Q80TY0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms