Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnf1Q7TSH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnf1Q7TSH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnf1Q7TSH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnf1Q7TSH7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms