Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcg2Q7TMS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcg2Q7TMS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcg2Q7TMS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcg2Q7TMS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcg2Q7TMS5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg2Q7TMS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms