Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,63■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,61■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21,58■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
ScocQ78YZ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,48■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
ScocQ78YZ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
ScocQ78YZ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,38■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,38■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
ScocQ78YZ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
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