Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pdcl2Q78Y63 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcl2Q78Y63 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcl2Q78Y63 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcl2Q78Y63 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl2Q78Y63 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl2Q78Y63 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms