Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efr3bQ6ZQ18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efr3bQ6ZQ18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efr3bQ6ZQ18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efr3bQ6ZQ18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efr3bQ6ZQ18 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Efr3bQ6ZQ18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efr3bQ6ZQ18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms