Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NinlQ6ZQ12 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NinlQ6ZQ12 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NinlQ6ZQ12 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NinlQ6ZQ12 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NinlQ6ZQ12 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NinlQ6ZQ12 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms