Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssxb5Q6XAS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb5Q6XAS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb5Q6XAS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssxb5Q6XAS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms