Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt9Q6RHW0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt9Q6RHW0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt9Q6RHW0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt9Q6RHW0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt9Q6RHW0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt9Q6RHW0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms