Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rhbdf1Q6PIX5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rhbdf1Q6PIX5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rhbdf1Q6PIX5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdf1Q6PIX5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rhbdf1Q6PIX5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rhbdf1Q6PIX5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rhbdf1Q6PIX5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.9 ms