Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc117Q6PB51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc117Q6PB51 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc117Q6PB51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc117Q6PB51 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc117Q6PB51 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc117Q6PB51 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms