Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Herc4Q6PAV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Herc4Q6PAV2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Herc4Q6PAV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herc4Q6PAV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Herc4Q6PAV2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Herc4Q6PAV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms