Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ9

Prrg3, Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg3Q6PAQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrg3Q6PAQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrg3Q6PAQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrg3Q6PAQ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrg3Q6PAQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms