Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fhod1Q6P9Q4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fhod1Q6P9Q4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fhod1Q6P9Q4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fhod1Q6P9Q4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fhod1Q6P9Q4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fhod1Q6P9Q4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fhod1Q6P9Q4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms