Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmnd1Q6P3A1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stmnd1Q6P3A1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stmnd1Q6P3A1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stmnd1Q6P3A1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stmnd1Q6P3A1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stmnd1Q6P3A1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms