Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt39Q6IFX4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt39Q6IFX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt39Q6IFX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt39Q6IFX4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt39Q6IFX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt39Q6IFX4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms