Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg9bQ6EBV9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg9bQ6EBV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9bQ6EBV9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9bQ6EBV9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9bQ6EBV9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg9bQ6EBV9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg9bQ6EBV9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9bQ6EBV9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms