Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nop58Q6DFW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Nop58Q6DFW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nop58Q6DFW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nop58Q6DFW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nop58Q6DFW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nop58Q6DFW4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nop58Q6DFW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms