Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ltn1Q6A009 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ltn1Q6A009 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ltn1Q6A009 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ltn1Q6A009 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ltn1Q6A009 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ltn1Q6A009 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ltn1Q6A009 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ltn1Q6A009 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ltn1Q6A009 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ltn1Q6A009 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms