Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BegainQ68EF6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BegainQ68EF6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BegainQ68EF6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BegainQ68EF6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BegainQ68EF6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BegainQ68EF6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BegainQ68EF6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BegainQ68EF6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BegainQ68EF6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BegainQ68EF6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BegainQ68EF6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms