Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms