Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp9cQ66X01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp9cQ66X01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrp9cQ66X01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp9cQ66X01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp9cQ66X01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms