Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6eQ64253 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6eQ64253 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6eQ64253 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6eQ64253 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6eQ64253 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ly6eQ64253 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms