Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccpg1Q640L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccpg1Q640L3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccpg1Q640L3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccpg1Q640L3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccpg1Q640L3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccpg1Q640L3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccpg1Q640L3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccpg1Q640L3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccpg1Q640L3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccpg1Q640L3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms