Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sin3bQ62141 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sin3bQ62141 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sin3bQ62141 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sin3bQ62141 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3bQ62141 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sin3bQ62141 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sin3bQ62141 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sin3bQ62141 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sin3bQ62141 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sin3bQ62141 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms