Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna1eQ61290 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1eQ61290 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1eQ61290 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1eQ61290 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1eQ61290 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1eQ61290 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms