Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ItgaeQ60677 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ItgaeQ60677 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ItgaeQ60677 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ItgaeQ60677 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ItgaeQ60677 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgaeQ60677 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms