Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpa6Q5U901 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa6Q5U901 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpa6Q5U901 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpa6Q5U901 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpa6Q5U901 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpa6Q5U901 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms