Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CluhQ5SW19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CluhQ5SW19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CluhQ5SW19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CluhQ5SW19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CluhQ5SW19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms