Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sco1Q5SUC9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sco1Q5SUC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sco1Q5SUC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sco1Q5SUC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sco1Q5SUC9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sco1Q5SUC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sco1Q5SUC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sco1Q5SUC9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sco1Q5SUC9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1169 ms