Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xaf1Q5NBU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xaf1Q5NBU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Xaf1Q5NBU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Xaf1Q5NBU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Xaf1Q5NBU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xaf1Q5NBU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms