Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy3Q5DTK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chsy3Q5DTK1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chsy3Q5DTK1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chsy3Q5DTK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy3Q5DTK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms