Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms