Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc55Q3UY51 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc55Q3UY51 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc55Q3UY51 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrc55Q3UY51 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc55Q3UY51 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc55Q3UY51 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc55Q3UY51 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms