Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BB287469Q3UT53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BB287469Q3UT53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BB287469Q3UT53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BB287469Q3UT53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BB287469Q3UT53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms