Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms